Ingénieur en Bioinformatique Structurale H/F - 60

La personne recrutée intègrera l'unité CNRS UMR 7025 Génie Enzymatique et Cellulaire (GEC) - département génie biologique (GB) et travaillera en collaboration avec le Laboratoire de Mathématiques Appliquées de Compiègne (LMAC).

Elle rendra compte au responsable du projet, entretiendra un dialogue régulier avec celui-ci et une collaboration étroite avec l'ensemble des interlocuteurs concernés.

Une station de travail adaptée pour des travaux de bionformatique sera à disposition de la personne recrutée.

L'UTC recrute un ingénieur contractuel F/H pour rejoindre le laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire - département génie biologique, dans le cadre d'un projet en collaboration avec le LMAC.

Ce recrutement s'inscrit dans le cadre du projet intitulé ORIGAMI « Conception rationnelle d'oligonucléotides simple brin functionnels par rempliement inversé pour des applications biotechnologiques », financé par le Programme de Prématuration du Pôle Universitaire d'Innovation de l'Alliance Sorbonne Université.

Mission
La personne recrutée participera à l'activité de recherche sur le développement d'un workflow numérique pour le repliement inverse des oligonucléotides simple brin.

Activités
Modélisation moléculaire in silico
Modélisation stochastique
Optimisation de protocoles in silico
Codage
Recherche bibliographique
Contexte
Les acides nucléiques simple brin (ssNAs), un outil biotechnologique très puissant, sont capables de reconnaitre spécifiquement et sélectivement des molécules grâce aux structures 3D qu'ils adoptent. Donc, la conception de ssNAs à visée thérapeutique ou diagnostique nécessite la définition de l'ensemble des séquences de ssNAs qui se replient en une structure cible (repliement inverse). Des outils numériques de repliement inverse existent, mais ils se bornent à fournir peu de résultats, sans les assortir d'une mesure de la qualité de la séquence fournie et se focalisent sur la structure 2D. Nous fournirons une procédure complète et généralisable, accessible via un web serveur, combinant des méthodes numériques et computationnelles et des validations expérimentales pour concevoir des séquences de ssNAs ayant une structure 3D et une fonction souhaitées. La première application visera la conception de ssNAs, brevetables, pour le diagnostic de la maladie de Lyme.